Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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ACACAQ13085 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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ACACAQ13085 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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