Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms