Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms