Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms