Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPCQ03188 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPCQ03188 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms