Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAV1Q03135 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms