Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms