Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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