Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2BQ00403 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms