Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPD2P62316 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms