Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPS3AP61247 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms