Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42P60953 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42P60953 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42P60953 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms