Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NLRP6P59044 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms