Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA9P57773 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA9P57773 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA9P57773 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA9P57773 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms