Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK4P57078 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms