Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLTPP55058 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLTPP55058 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLTPP55058 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLTPP55058 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLTPP55058 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLTPP55058 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLTPP55058 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLTPP55058 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLTPP55058 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLTPP55058 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLTPP55058 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLTPP55058 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLTPP55058 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLTPP55058 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLTPP55058 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLTPP55058 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLTPP55058 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLTPP55058 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLTPP55058 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLTPP55058 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLTPP55058 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLTPP55058 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLTPP55058 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLTPP55058 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLTPP55058 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLTPP55058 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms