Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB3P54284 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms