Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3M2P53677 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M2P53677 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms