Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms