Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB28P51157 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB28P51157 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB28P51157 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB28P51157 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB28P51157 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB28P51157 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB28P51157 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB28P51157 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB28P51157 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB28P51157 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB28P51157 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB28P51157 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB28P51157 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB28P51157 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB28P51157 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB28P51157 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB28P51157 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB28P51157 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms