Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSEN1P49768 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms