Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB2P47870 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms