Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RANGAP1P46060 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
RANGAP1P46060 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
RANGAP1P46060 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RANGAP1P46060 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
RANGAP1P46060 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RANGAP1P46060 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms