Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNT2P45379 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNT2P45379 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms