Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZEB1P37275 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZEB1P37275 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms