Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms