Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 GPS1-209ENST00000578642 579 ntTSL 421.13■□□□□ 0.972e-9■■□□□ 13.9
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GTF2F1P35269 GPS1-212ENST00000580716 567 ntTSL 418.98■□□□□ 0.632e-9■■□□□ 13.9
GTF2F1P35269 GPS1-213ENST00000580723 594 ntTSL 418.9■□□□□ 0.622e-9■■□□□ 13.9
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GTF2F1P35269 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.522e-9■■□□□ 13.9
GTF2F1P35269 GPS1-207ENST00000578392 552 ntTSL 418.22■□□□□ 0.512e-9■■□□□ 13.9
GTF2F1P35269 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.492e-9■■□□□ 13.9
GTF2F1P35269 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.412e-9■■□□□ 13.9
GTF2F1P35269 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.42e-9■■□□□ 13.9
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GTF2F1P35269 GPS1-220ENST00000583885 594 ntTSL 413.38□□□□□ -0.272e-9■■□□□ 13.9
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GTF2F1P35269 KLHL14-202ENST00000359358 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.542e-6■■□□□ 13.9
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GTF2F1P35269 PPP4R4-204ENST00000555690 680 ntTSL 327.71■■■□□ 2.039e-7■■□□□ 13.9
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GTF2F1P35269 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.519e-7■■□□□ 13.9
GTF2F1P35269 FAM208B-213ENST00000532424 433 ntTSL 324.23■■□□□ 1.479e-7■■□□□ 13.9
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GTF2F1P35269 SEPT9-223ENST00000589140 552 ntTSL 421.99■■□□□ 1.119e-7■■□□□ 13.9
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GTF2F1P35269 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.139e-7■■□□□ 13.9
GTF2F1P35269 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.023e-8■■□□□ 13.9
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GTF2F1P35269 NFATC3-221ENST00000570212 3181 ntTSL 1 (best)6.84□□□□□ -1.319e-7■■□□□ 13.9
GTF2F1P35269 PPP4R4-205ENST00000556470 589 ntTSL 46.63□□□□□ -1.359e-7■■□□□ 13.9
GTF2F1P35269 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.379e-7■■□□□ 13.9
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GTF2F1P35269 NFATC3-205ENST00000535127 4194 ntTSL 1 (best)6.3□□□□□ -1.49e-7■■□□□ 13.9
GTF2F1P35269 FAM208B-208ENST00000482419 424 ntTSL 26.2□□□□□ -1.429e-7■■□□□ 13.9
GTF2F1P35269 TBCK-212ENST00000506615 593 ntTSL 36.17□□□□□ -1.429e-7■■□□□ 13.9
GTF2F1P35269 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.469e-7■■□□□ 13.9
GTF2F1P35269 NFATC3-214ENST00000563796 3753 ntTSL 1 (best)5.27□□□□□ -1.579e-7■■□□□ 13.9
GTF2F1P35269 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.659e-7■■□□□ 13.9
GTF2F1P35269 PPP4R4-203ENST00000553661 564 ntTSL 44.67□□□□□ -1.669e-7■■□□□ 13.9
GTF2F1P35269 PPP4R4-206ENST00000556884 564 ntTSL 44.54□□□□□ -1.689e-7■■□□□ 13.9
GTF2F1P35269 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.122e-7■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 RTKN-204ENST00000460968 842 ntTSL 214.64□□□□□ -0.073e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ING5-206ENST00000482774 2376 ntTSL 321.48■■□□□ 1.035e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.425e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ING5-210ENST00000492488 822 ntTSL 216.77■□□□□ 0.285e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ING5-209ENST00000489509 920 ntTSL 216.71■□□□□ 0.275e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ING5-211ENST00000493261 543 ntTSL 213.2□□□□□ -0.35e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 NDUFS3-211ENST00000533507 1769 ntTSL 227.67■■■□□ 2.025e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.995e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 PHYKPL-211ENST00000494126 2297 ntTSL 1 (best)27.27■■□□□ 1.965e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 PHYKPL-204ENST00000474052 1539 ntTSL 1 (best)25.66■■□□□ 1.75e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 PHYKPL-209ENST00000489262 2780 ntTSL 225.28■■□□□ 1.645e-6■■□□□ 13.8
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