Protein–RNA interactions for Protein: P31350

RRM2, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM2P31350 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRM2P31350 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRM2P31350 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRM2P31350 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRM2P31350 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRM2P31350 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRM2P31350 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRM2P31350 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRM2P31350 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRM2P31350 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRM2P31350 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RRM2P31350 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RRM2P31350 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RRM2P31350 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RRM2P31350 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RRM2P31350 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RRM2P31350 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RRM2P31350 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRM2P31350 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms