Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC13P31276 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms