Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR1EP28566 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms