Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms