Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCM3P25205 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCM3P25205 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MCM3P25205 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms