Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKACBP22694 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms