Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms