Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSPP15924 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DSPP15924 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSPP15924 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSPP15924 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSPP15924 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSPP15924 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSPP15924 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSPP15924 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSPP15924 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSPP15924 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSPP15924 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSPP15924 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSPP15924 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSPP15924 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSPP15924 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSPP15924 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSPP15924 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSPP15924 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSPP15924 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSPP15924 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSPP15924 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms