Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DMDP11532 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DMDP11532 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DMDP11532 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
DMDP11532 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DMDP11532 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
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