Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAMP11215 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms