Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI3P10071 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI3P10071 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI3P10071 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI3P10071 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI3P10071 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms