Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms