Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHOP08100 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHOP08100 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHOP08100 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms