Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms