Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD2O96028 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NSD2O96028 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NSD2O96028 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD2O96028 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD2O96028 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD2O96028 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSD2O96028 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSD2O96028 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSD2O96028 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms