Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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