Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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KDM4BO94953 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KDM4BO94953 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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