Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLIT2O94813 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLIT2O94813 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLIT2O94813 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLIT2O94813 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLIT2O94813 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLIT2O94813 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLIT2O94813 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLIT2O94813 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLIT2O94813 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLIT2O94813 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLIT2O94813 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLIT2O94813 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLIT2O94813 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLIT2O94813 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLIT2O94813 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLIT2O94813 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLIT2O94813 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLIT2O94813 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLIT2O94813 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms