Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms