Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCO2O43819 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCO2O43819 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCO2O43819 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCO2O43819 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCO2O43819 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCO2O43819 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCO2O43819 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCO2O43819 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCO2O43819 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCO2O43819 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCO2O43819 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCO2O43819 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCO2O43819 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms