Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CLOCKO15516 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLOCKO15516 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms