Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms