Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms